서울시보건환경연구원에서는 서울시내 요양병원 등 의료기관에서 의뢰된 CRE 검사와 CPE(Carbapenemase Producing Enterobateriaceae, 카바페넴 분해효소 생성 장내세균) 검사를 수행하고 있다. CRE 검사는 항생제감수성 시험을 통해 카바페넴 내성 유무를 진단하고, CPE 검사는 유전자 분석으로 카바페넴 분해효소를 확인하여 감염증 발생에 대한 역학적 연관성 확인을 위한 자료로 활용되고 있다.