서울시보건환경연구원은 BL3(생물안전 3등급 고위험병원체 취급시설) 운영과 관련하여, 「2023 한국생물안전콘퍼런스」에서 생물안전관리 유공기관으로 선정되어 보건복지부장관상을 수상하였다.
