2023년 인플루엔자(독감) 유행이 1년 넘게 이어지고 있는 가운데, 올겨울(2023-2024절기) 인플루엔자 환자수는 역대급 수치를 기록하였다. 서울시보건환경연구원은 질병관리청과 협업하여 진행하는 급성호흡기감염증 감시사업으로 매주 협력병원(1차 의료기관 8개소)에서 의뢰한 호흡기 환자의 상기도 검체에서 인플루엔자 및 호흡기 바이러스 8종을 검사하고 있다.
서울시보건환경연구원은 매주 서울 지역 관내 하수처리장에서 채취된 하수로부터 코로나19(SARS-CoV-2) 등 주요 감염병 3종*에 대한 감시를 수행하고 있다.